При выращивании рассады садоводы - любители рискуют столкнуться с трудностями, связанными с обнаружением различных вредителей и проявлением болезней на рассаде.Самой распространённой болезнью рассады является чёрная ножка. 

 
В этом случае стебель на уровне почвы становится тёмно - коричневым, ткани его как бы впадают, буреют, стебель утончается и гниёт. Причиной этой болезни являются фитопатогенные грибы и бактерии, находящиеся в почве. Поэтому для выращивания рассады нужно использовать почву, не несущую инфекции, предварительно подвергая её термическому обеззараживанию. Далее желательно использовать биологический препарат триходермин. Им опудривают семена, вносят его в почву перед посевом. Или во время вегетации можно поливать рассаду суспензией ризоплана, разведённого в 100 раз.

Вредителей на рассаде может быть много: различные виды тлей, тепличная белокрылка, табачный трипс, огуречный комарик, паутинные клещи, галловые нематоды и другие.

Чтобы избежать развитие тлей  на рассаде, нужно предусмотреть ряд профилактических мер : предварительное промораживание почвы, удаление декоративных растений. Если всё-таки тли обнаружены, то нужно обработать растение препаратами.
Следует так же помнить, что тли, помимо прочего, являются переносчиками вирусных болезней растений.

Тепличная  белокрылка - мелкое  насекомое 1-1,5 мм с двумя парами мучнисто - белых крыльев. Самки откладывают яйца группами, часто в виде кольца, на нижнюю сторону молодых листьев. Личинки и взрослые особи белокрылки, питаются клеточным соком, выделяя при этом сахаристые вещества (падь), на которых развиваются сажистые грибы, способствующие снижению фотосинтеза растений. При сильном повреждении листья скручиваются и засыхают. Наиболее вредоносна белокрылка для баклажана, томата, огурца, перца, декоративных растений. В борьбе с этим вредителем можно рекомендовать только профилактические меры: изоляцию рассады и декоративных культур, где может зимовать вредитель. Химические препараты применять нежелательно, но при очень большой численности можно провести опрыскивание препаратами.

Огуречный комарик - мелкое насекомое 3,5-4,5 мм в длину. Личинки блестящие, полупрозрачные, с просвечивающимся тёмным кишечником. Зимуют взрослые личинки в коконах в почве. В почву попадают с некомпостированным навозом. Личинки внедряются в корень или основание стебля, проделывая в них ходы и размочаливая ткани. Растения, заселённые личинками комарика, внешне заметны по привяданию листьев. При сильном заселении вредителем ( в корнях одного растения можно обнаружить свыше 50 личинок.) растения увядают и отмирают.

   В качестве профилактических мероприятий  можно рекомендовать компостирование навоза и термическое обеззараживание почвы.